Lincoln Six-Echo (Ewan McGregor) ve Jordan Two-Delta (Scarlett Johansson), kusursuz dizayn edilmiş dışa kapalı bir klonlama tesisinde yaşamaktadırlar. Çok fazla özen gösterilen bu tesiste dış dünyadanın kirlenmişliğinden arındırılmış klonlar dünyadaki tek kirlenmemiş yer olduğu söylenen bir adaya gönderilmek için şanslı olanlar kura ile seçilirler.